大棚蔬菜由于种植经济效益高，可以反季节栽培，近年来在蔬菜种植区大量发展，对我国的蔬菜供应及出口做出了很大贡献。但是连续种植同种作物几年后，大棚种植总会出现僵苗、死苗、叶片焦枯、落花落果、果实畸形等症状，土面则表现泛白似盐霜，土壤板结坚硬，通透性差等现象。而造成这些现象发生的根源，还在于施肥不科学、过度消耗土壤本身调节能力以及连作同种作物有害微生物及其代谢产物积累等有关。
一、连作障碍发生的原因：
1、土壤盐渍化：
首先，连作影响土壤养分的分配和平衡。在设施内植物对所需养分吸收有限，而人为施肥多偏爱施氮磷钾等大量元素，对微肥及炭肥重视不够，造成单一元素积累过多，而需要的又连年消耗得不到补充，土壤内养分平衡必然失调。其次，各植物根系分布有深有浅，年年连作，同种作物根系吸收范围较为固定，造成营养缺乏。如此以往，造成土壤有机质被大量消耗，盐分大量积累，从而使土壤板结，有机质含量下降，土壤质地变得粘重，透气性严重破坏；土壤pH和全盐含量显著增加。另一方面，棚室的环境相对封闭，为了追求高产，通常亩栽植量是通常大田栽培的2倍以上，土地利用率高，肥料用量大，加之旱作管理，长期没有雨水淋洗土壤，使得肥料不能随水淋溶，富集在土壤耕作表层；同时棚室内温度高，土壤水分蒸发量大，又会使土壤深层的盐分上升到表层，更加重了表层种植土的盐分含量，长此以往造成土壤盐渍化加重。而盐渍化会直接对根部环境形成反渗透压，造成作物吸收障碍，导致出苗不齐，产量下降，品质变差等现象发生。
2、作物自毒物质的积累
某些作物可通过地上部淋溶、根系分泌和作物残茬、落叶腐解等途径释放一些物质，对同茬或下茬同种或同科作物生长发育产生抑制作用，这种现象叫自毒作用。多年连作，势必引起的自毒作用越来越明显，连作障碍就会出现，连作时间越长，障碍越严重。
3、土壤有益菌减少，有害菌积累，导致土传病害加重
由于连作，形成了特殊的土壤环境，使固氮菌、根瘤菌、光合菌、放线菌、硝化细菌、氨化细菌、菌根真菌等有益微生物的生长繁殖受到抑制，而有害微生物大量滋生，土壤的微生物区系发生变化。特别是保护地蔬菜和复种指数高，一年四季不歇地，病虫害源不断积累，导致土传病害发生较重，而且发现很多新的病源菌导致的病害发生，形成了近年来的“用药不治病”的现象。
4、元素平衡被破坏
由于蔬菜对土壤养分吸收的选择性，单一茬口易使土壤中矿质元素的平衡状态遭到破坏，营养元素之间的拮抗作用常影响到蔬菜对某些元素的吸收，容易出现缺素症状，使生育受阻，产量和品质下降。
二、破解大棚蔬菜种植连作障碍措施
1、轮作和间作套种是改善连作障碍的有效措施：
轮作和间作套种能显著增加基质中微生物总量和细菌数量，降低真菌数量，土壤微生态得到极大改善，丰富微生物多样性，对减轻连作障碍效果显著。有相关报道：玉米、大豆根系分泌物可促进马铃薯块茎萌发和萌芽生长。大蒜与瓜类轮作可显著减轻连作造成的瓜类枯萎病害；黄瓜和番茄交替种植能显著提高黄瓜根际细菌和放线菌的数量。番茄轮作能降低黄瓜连作土壤容重和电导率，提高土壤pH，增加碱解N、有效P和有效K的含量。由此可见，合理的轮作和间作套种对改善土壤微生物群落结构作用明显，可减少病原真菌数量，优化土壤微生物区系结构和土壤理化性状，提高土壤中有效养分含量，使土壤环境向有利于作物生长的方向发展。
2、大棚土壤消毒
土壤消毒可减轻设施土壤连作障碍，夏季高温天气通过高温消毒，在灌水后高温闷棚，温度可达50 ℃以上杀虫，也可采用日光消毒的方式于夏季休茬期撤掉棚膜，深翻土壤，利用紫外线消毒；在冬季撤膜后采用低温消毒，深翻土壤，利用冬季的低温冻死病虫及虫卵；在密闭条件下也可采用利用硫磺粉熏蒸杀菌（酸性土壤慎用）；通过初染病株和携带病菌的残茬，防止病害蔓延和植株残体分解产生的化感物质进入土壤，并配合增施氰胺类肥料（石灰氮，药肥合一的代表）也能有效防治地下害虫和土传病害。土壤生物消毒的方法在克服连作障碍上具有较大的应用潜力。
3、土壤改良剂
